Die weitläufigen Gartenanlagen der Casa do Capitão sind über die Jahre gewachsen und erweitert worden; sie ordnen sich zwischen den Gebäuden, den Patios, der Zisterne und der Dreschtenne in fünf verschiedenen Aspekten und bieten weite Ausblicke.

Die Pflanzenwelt ist endemisch, subtropisch und in einigen Fällen sogar exotisch.
Das milde und feuchte azorianische Klima begünstigt den Wuchs vielerlei Pflanzenarten, so dass der Garten zu jeder Jahreszeit attraktive und vielfältige Farbenpracht aufweist.
Bei trockenem Wetter wird das Frühstück im Jardim da Eira (Garten der Dreschtenne) eingenommen und auf Wunsch kann der Nachmittagstee- oder -kaffee im Jardim do Mirante (Garten des Ausblicks) serviert werden, wo man den Blick über die Weiten des Atlantiks schweifen lassen kann.